16秒设计PD-L1结合蛋白，一张DGX Spark就够

Hugging Face上有个蛋白设计模型，叫RFD4-Proteína。模型卡里最扎眼的一组数字是：给PD-L1做结合蛋白，一张DGX Spark上16秒出设计。

蛋白设计可以理解成给定一个靶点，生成能结合它的蛋白序列和结构。RFD4-Proteína把序列和完整3D结构一起生成，输入可以是目标蛋白、motif或小分子。PD-L1是常见免疫检查点靶点，做它的结合蛋白有明确应用场景。

模型卡列了9个示例，7个按原样跑通。单个设计耗时3到46秒。PD-L1这例是16秒。

显存需求1.5GB。一张Spark绰绰有余。模型卡给的H200时间约快7倍。快7倍有意义，但1.5GB这个门槛更值得看，它把蛋白设计从多卡队列拉到桌面机器上。

下面的视频展示多类设计结果。彩色链是新设计，灰色是目标。需要说清楚：这些是计算设计，没有湿实验验证，也就是还没在实验室里真做出来测。

来源是ata在X上的帖子，模型卡在Hugging Face，原帖链接：https://x.com/atasrb/status/2117711776242442616。

一个判断：当生成速度到秒级、显存到1.5GB，瓶颈会往湿实验验证和筛选挪。能不能设计出来是一回事，设计出来能不能结合、稳不稳定、有没有活性，实验室说了算。